das Virus kam aus Krasnodar

[gsgs]

3 Viren-Sequenzen vom Sommer sind veroeffentlicht !
Zwar nur HA und NA und auch nicht ganz vollstaendig,
aber immerhin.
Auffallend die Aehnlichkeit zum Virus aus Krasnodar am
Schwarzen Meer vom September.
Von jenem Virus ist das gesamte Genom bekannt. Hier
http://magictour.free.fr/panflu/qinghai2.bmp
kann man sehen, wie die Viren sich genetisch vom
Qinghai-Urtyp entfernen, mit Ausnahme der Viren
aus Ungarn und England vom Februar, die evtl.
ein halbes Jahr lang irgendwo eingefroren waren.
Damit ist klar, dass das Virus vermutlich noch in diesem
aus Russland hierher verbracht wurde und nicht etwa schon
im letzen Jahr hier war.
Die Viren die letztes Jahr in Mitteleuropa
gefunden wurden sind wohl allesamt ausgestorben.

Eine grosse Vogelroute fuehrt von den riesigen Nord-West-Sibierischen
Feuchtgebieten zum Schwarzen Meer und dann vielleicht(?)
entlang der Donau. Welche Arten da jetzt infrage kommen -
da muesste man mal die Ornitologen fragen.
Allerdings setzt die saisonale SuedWest-Wanderung eigentlich
erst im Spaetsommer oder Herbst ein, da koennen die ja wohl
kaum schon im Juli in Nuernberg gewesen sein.

mehr hier:
http://www.flutrackers.com/forum/showthread.php?t=42368
in Englisch.


[das mit den Zugvoegeln ist am 30.Nov., 9Uhr neu ueberdacht
und editiert worden]

[gsgs]

HA und NA aneinandergereiht:

                                                         00000000000000000000000000000001111111111111111111111 000000000000000000000000000001111111111 
                                                         00000001111112344444555567788990111222233344445555556 011111111223444455677778899990000012223 
                                                         11133893348894001234013603645491125133706935780356794 612244459140012558122490904551136772382 
                                                         15715462573660447984813700805597981836222218429449505 161325708636341985803101168191778744416 
-codon-position------------------------------------------2 212       1 12    112  1        2         1  1    1 121 11      1 1       1     2  2  1 1   
---Index-------------------------------------------------TGTGGGTCCGTACCGAACGCAAGGGTCTGCCACGACTTACATGCATTGAAACG AAGGCACCGCTCCATGGCTAGCGAACTGCCCATGCAATG 
  1 >A/Qinghai-strain/index/05 HA+NA                     ..................................................... ....................................... 
  2 >A/chicken/Afghanistan/1207/2006(H5N1)               C.CA.....AC..T...A...G.....C........C..T...........T. .........T........C......T...TT...T.... 
  3 >A/chicken/Afghanistan/1573-47/2006(H5N1)            ...A......C..T.......G.....C........C..T...........T. ...A.G...T........C......T...TT...T.... 
  4 >A/chicken/Afghanistan/1573-65/2006(H5N1)            ...A...T..C..T.......G.....C........C..T.C.........T. .........T........C......T...TT...T.... 
  5 >A/chicken/Afghanistan/1573-92/2006(H5N1)            ...A......C..T.......G.....C........C..T...........TA ..................C.....TT...TTC..T.... 
  6 >A/chicken/Afghanistan/1573-7/2006(H5N1)             ...A......C..T.......G.....C........C..T...........T. ..................C.....TT...TTC..T.... 
  7 >A/chicken/Afghanistan/1207/2006(H5N1)               -------...C..T.......G.....C........C..T......C....T. --------------------------------------- 
  8 >A/duck/Tuva/01/2006(H5N1)                           .A.A......C..T..C...G.....TC........C.GT.......T...T. ....T.......TGAA..C.........TTT..AT.... 
  9 >A/common goldeneye/Mongolia/12/2006(H5N1)           ...A......C..T.......G....TC........C.GT.......T...T. ....T..T..........C..T......TTT...T...A 
 10 >A/grebe/Tyva/Tyv06-2/06(H5N1)                       ...A.T....CGTT.G.....G....TC..T.....CCGT.......T...T. ....T.T....T......C....G....TTT...T...A 
 11 >A/Grebe/Tyva/Tyv06-8/2006(H5N1)                     ...A.T....CGTT.G.....G....TC..T.....CCGT.......T...T. ....T.T....T......C....G....TTT...T...A 
 12 >A/grebe/Tyva/Tyv06-1/2006(H5N1)                     ...A......C..T.......G....TC......G.C.GT.......T...T. ....T.............CG........TTT...T...A 
 13 >A/whooper swan/Mongolia/2/06(H5N1)                  ...A......C..T.......G....TC........C.GT.......T...T. G...T.............C.........TTT...T..GA 
 14 >A/black-necked grebe/Germany/R1393/07(H5N1),Jul19   ...AA.G...C..T.....T.GT..GTC.T..T..TC.GT..A....T.GGT. ----------------..C.A.......TTT.------- 
 15 >A/chicken/Krasnodar/300/07(H5N1)                    ...AA.G...C..TT....T.GTAA.TCAT..T..TC.GT..A..C.T.GGT. .TA.....A.C.....A.C.A......ATTT.C.TGG.A 
 16 >A/mute swan/Germany/R1349/07(H5N1),Jul6             ...A..G.T.C..T....AT.GT...TC.T..TA.TC.GTG.A....TTGGT. .TA.............ATC.A.A...C.TTT.C.TGG.A 
 17 >A/mute swan/Germany/R1359/07(H5N1),Jul6             ...AA.G...C..T.....T.GT...TC.T.GTA.TC.GT..ATG..T.GGT. ----------------A.C.A.......TTT.------- 
                                                                                                                                                       
---Index-------------------------------------------------TGTGGGTCCGTACCGAACGCAAGGGTCTGCCACGACTTACATGCATTGAAACG AAGGCACCGCTCCATGGCTAGCGAACTGCCCATGCAATG 
-codon-position------------------------------------------2 212       1 12    112  1        2         1  1    1 121 11      1 1       1     2  2  1 1   
                                                                                                               
                                                         00000000000000000000000000000001111111111111111111111 000000000000000000000000000001111111111 
                                                         00000001111112344444555567788990111222233344445555556 011111111223444455677778899990000012223 
                                                         11133893348894001234013603645491125133706935780356794 612244459140012558122490904551136772382 
                                                         15715462573660447984813700805597981836222218429449505 161325708636341985803101168191778744416

          Ur-Qinghai(hypothetisch),2005
                   |
                   | 13
                   |
                   |
          Afghanistan,2006
                   |
                   | 6+1
                   |
                   |
          Mongolei,Sibirien,2006
                   |
                   |
                   | 17+1
                   |
                   |
          Russland(hypothetisch),2007
             /     |         \      \
           / 8     |1+?       \ 4+?    \ 8+1
         /         |           \          \
Krasnodar,2007  DE1393,2007  DE1359,2007  DE1349,2007

[SetsukoAi]

schön schön

[dr.huehners]

Niedlich, auch diese ganzen Aminosäuren... Was sagt uns das hier nun

[Oggy]

Moin,
der Kommunismus kam aus Moskau ===>überlebt
die radioaktive Wolke kam aus Tschernobyl ===>überlebt

also was solls??!!

[SetsukoAi]

Original von gsgs
HA und NA aneinandergereiht:

 
                                                                    00000000000000000000000000000001111111111111111111111111111111122222222222222222222222222233333 
                                                                     00000001111112344444555567788990111222333444455555567778999999900012223444555667777888889900011 
                                                                     11133893348894001234013603645491125137069357803567940554001299946955660036678343599045681227827 
                                                                     15715462573660447984813700805597981862222184294495052458380924753030186525708788358628445411183 
-codon-position------------------------------------------------------2 212       1 12    112  1        2        1  1    112  1 2  222222 2 2222222 222221122122 2 22 
---Index-------------------------------------------------------------TGTGGGTCCGTACCGAACGCAAGGGTCTGCCACGACTACATGCATTGAAACG                                            
  1 >A/Bar-headed Goose/Qinghai/62/05(H5N1)                          ............................................................................................... 
  2 >A/chicken/Afghanistan/1207/2006(H5N1)                           C.CA.....AC..T...A...G.....C..........T...........T.C...........T........C......T...ATT...T.... 
  3 >A/chicken/Afghanistan/1573-47/2006(H5N1)                        ...A......C..T.......G.....C..........T...........T.C.....A.G...T........C......T...ATT...T.... 
  4 >A/chicken/Afghanistan/1573-65/2006(H5N1)                        ...A...T..C..T.......G.....C..........T.C.........T.C...........T........C......T...ATT...T.... 
  5 >A/chicken/Afghanistan/1573-92/2006(H5N1)                        ...A......C..T.......G.....C..........T...........TAC....................C.....TT...ATTC..T.... 
  6 >A/chicken/Afghanistan/1573-7/2006(H5N1)                         ...A......C..T.......G.....C..........T...........T.C....................C.....TT...ATTC..T.... 
  7 >A/chicken/Afghanistan/1207/2006(H5N1)                           -------...C..T.......G.....C..........T......C....T.C..---------------------------------------- 
  8 >A/duck/Tuva/01/2006(H5N1)                                       .A.A......C..T..C...G.....TC.........GT.......T...T.C......T.......TGAA..C.........TATT..AT.... 
  9 >A/common goldeneye/Mongolia/12/2006(H5N1)                       ...A......C..T.......G....TC.........GT.......T...T.C......T..T..........C..T......TATT...T...A 
 10 >A/grebe/Tyva/Tyv06-2/06(H5N1)                                   ...A.T....CGTT.G.....G....TC..T.....CGT.......T...T.CAG....T.T....T......C....G....TATT...T...A 
 11 >A/Grebe/Tyva/Tyv06-8/2006(H5N1)                                 ...A.T....CGTT.G.....G....TC..T.....CGT.......T...T.CAG....T.T....T......C....G....TATT...T...A 
 12 >A/grebe/Tyva/Tyv06-1/2006(H5N1)                                 ...A......C..T.......G....TC......G..GT.......T...T.CAG....T.............CG........TATT...T...A 
 13 >A/whooper swan/Mongolia/2/06(H5N1)                              ...A......C..T.......G....TC.........GT.......T...T.C..G...T.............C.........TATT...T..GA 
 14 >A/black-necked grebe/Germany/R1393/07(H5N1) ,HA , 19-JUL-2007   ...AA.G...C..T.....T.GT..GTC.T..T..T.GT..A....T.GGT.TTT----------------..C.A.......TATT.------- 
 15 >A/chicken/Krasnodar/300/07(H5N1)                                ...AA.G...C..TT....T.GTAA.TCAT..T..T.GT..A..C.T.GGT.T...TA.....A.C.....A.C.A......ATATT.C.TGG.A 
 16 >A/mute swan/Germany/R1349/07(H5N1), 06-JUL-2007                 ...A..G.T.C..T....AT.GT...TC.T..TA.T.GTG.A....TTGGT.TTT.TA.............ATC.A.A...C.TATT.C.TGG.A 
 17 >A/mute swan/Germany/R1359/07(H5N1), HA, 06-JUL-2007             ...AA.G...C..T.....T.GT...TC.T.GTA.T.GT..ATG..T.GGT.T..----------------A.C.A.......TATT.------- 
                                                                                                                                                                     
---Index-------------------------------------------------------------TGTGGGTCCGTACCGAACGCAAGGGTCTGCCACGACTACATGCATTGAAACG                                            
-codon-position------------------------------------------------------2 212       1 12    112  1        2        1  1    112  1 2  222222 2 2222222 222221122122 2 22 
                                                                     00000000000000000000000000000001111111111111111111111111111111122222222222222222222222222233333 
                                                                     00000001111112344444555567788990111222333444455555567778999999900012223444555667777888889900011 
                                                                     11133893348894001234013603645491125137069357803567940554001299946955660036678343599045681227827 
                                                                     15715462573660447984813700805597981862222184294495052458380924753030186525708788358628445411183

          Mongolia,Siberia,2006
                   |
                   |
                   | 12
                   |
                   |
          Russia(hypothetical),2007
             /     |         \      \
           / 8     |4         \ 6      \ 11
         /         |           \          \
Krasnodar,2007  Germany1393  Germany1359  Germany1349

Mich erinnert das hier eher an einen Cobol Code (Programmiersprache) und was kann das Programm jetzt? Kaffee kochen?

[Claudja]

Bei Cobol brauchste nur ein Leerzeichen zuviel machen und schon spielt das Programm Geldautomat. Was hat das jetzt mit H5N1 zu tun

Grüsserchen
Claudia

[gsgs]

man sieht die Verwandtschaftsverhaeltnisse der Viren, wie sich Mutationen langsam
aufbauen : Qinghai 2005 --> Aghanistan --> Mongolei,Tuva --> Krasnodar,Germany

Eine direkte Linie findet man fast nie bei diesen Stichproben, also muss
man sehen dass man die "toten Enden" der Mutationen erkennt und rausfiltert.

Ob das Virus per Schiff,Auto,Flugzeug oder Fluegelschlag zu uns kam weiss man nie so genau.
Aber wann und von wo laesst sich schon erahnen.

[gaby]

Also kann man nicht nachweisen wie der Virus zu Anfang aussah, und ob die Mutationen so stattgefunden haben kann man auch nur raten? Man ergänzt fehlende Stränge und sagt: So muss das sein und gut?

Und wer sagt dass das richtig geraten ist? Testen wir dann mal aus ob es dieselben Syptome auslöst wie das Originalvirus?

Zusammenfassend wie ich das jetzt verstanden habe: Es ist also nichts gefunden worden was vollständig war, und deshalb hat man Vermutungen angestellt wie es sein könnte. Aufgrund dieser Hypothesen sagt man dann die Viren stammen von dem u. dem Virus ab. Also weiss man garnichts sondern unterstellt einfach was?

Hab ich das so richtig verstanden?

gg

[Wontolla]

Boah!
Die Wissenschaft ist voller Rätsel. Da geht es nicht ohne Vermutungen, Annahmen und Unterstellungen. Das System ist immer das gleiche. Es beginnt mit einer Hypothese, das sind vage Ahnungen oder bestenfalls Vermutungen. Bei Otto Normalo kommt das aber schon als neue Wahrheit an. Wenn's jemanden interessiert, dann wird erst mal studiert. Nach den Studien wird es meistens wieder verworfen. Stecken geballte finanzielle Interessen dahinter, dann wird die Hypothese mittels Studien zur Theorie bewiesen. Wer das durchschaut und aufmuckt, wird zum Aussenseiter gestempelt und mundtot gemacht.
H5N1 ist ein Paradebeispiel für moderne "Wissenschaft".