Qinghai-Viren

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16.09.2007, 19:19
gsgs

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Qinghai-Viren

hier eine Graphik der Mutationenanzahl verschiedener Qinghai-Viren.
Das sieht so aus, als ob der Ungarn/Suffolk Virus ein Jahr lang
eingefroren gewesen waere !

A/Ck/Moscow/2/07
2007/02/16
A/Azerbaijan/008-208/06
2006/02/10
A/Ck/Krasnodar/123/06
2006/02/20
A/WSw/Iran/754/06
2006/02/14
A/MSw/Italy/742/06
2006/02/10
A/Ck/Afghanistan/1207/06
2006/03/12
A/Grebe/Tyva/Tyv06-1/06
2006/06/24
A/WSw/Mongolia/2/06
2006/06/06
A/Grebe/Tyva/Tyv06-8/06
2006/06/24
A/Ck/Liaoning/23/05
2005/11/03
A/GFowl/Shantou/1341/06
2006/10/29
A/PiedMagpie/Liaoning/7/05
2005/11/03
A/Ck/InnerMongolia/64/05
2005/11/20
A/Ck/Tula/4/05
2005/10/18
A/Dk/Novosibirsk/02/05
2005/07/20
A/Gs/Suzdalka/10/05
2005/07/20
A/Tr/Suzdalka/12/05
2005/07/20
A/Ck/Suzdalka/06/05
2005/07/20
A/Ck/Omsk/14/05
2005/10/18
A/BaHGs/Qinghai/62/05
2005/05/22
A/BaHGs/Qinghai/65/05
2005/05/22
A/Grebe/Novosibirsk/29/05
2005/07/20
A/Gs/Qinghai-strain/index/05
2005/01/01
A/Dk/Novosibirsk/56/05
2005/07/20
A/Ck/Crimea/08/05
2005/12/02
A/Ck/Kurgan/05/05
2005/07/31
A/Dk/Kurgan/08/05
2005/07/31
A/MSw/Astrakhan/2-4/05
2005/11/26
A/Gs/Krasnoozerskoe/627/05
2005/10/21
A/MSw/Astrakhan/2-3/05
2005/11/26
A/MSw/Croatia/1/05
2005/10/21
A/Sw/Germany/R65/06
2006/02/22
A/Cat/Germany/606/06
2006/03/11
A/buzzard/Denmark/6370/06
2006/03/11
A/Ck/NGA/1047-30/06
2006/02/13
A/Dk/Niger/914/06
2006/02/27
A/Ck/NGA/1047-54/06
2006/02/13
A/Ck/NGA/957-20/06
2006/02/13
A/Ck/NGA/1047-34/06
2006/02/13
A/Ostrich/NGA/1047-25/06
2006/02/13
A/GFowl/NGA/957-12/06
2006/02/13
A/Ck/NGA/1047-8/06
2006/02/13
A/Ck/NGA/1047-62/06
2006/02/13
A/Ck/NGA/641/06
2006/01/17
A/Ck/Sudan/1784-7/06
2006/04/18
A/Ck/Sudan/1784-10/06
2006/04/18
A/Dk/CIV/1787-18/06
2006/04/26
A/Ck/CIV/1787-34/06
2006/04/26
A/Ck/CIV/1787-35/06
2006/04/26
A/Ck/Kurgan/3/05
2005/08/02
A/BaHGs/Mongolia/1/05
2006/06/06
A/WSw/Mongolia/3/05
2006/06/06
A/Turkey/65596/06
2006/01/11
A/Turkey/12/06
2006/01/11
A/Turkey/15/06
2006/01/11
A/Turkey/651242/06
2006/01/11
A/Iraq/755/06
2006/02/04
A/Iraq/1/06
2006/02/04
A/Tr/England/250/07
2007/02/11
A/Gs/Hungary/3413/07
2007/01/25
A/Gs/Hungary/2823/07
2007/01/25
A/MSw/Italy/808/06
2006/06/06
A/Mallard/Italy/835/06
2006/02/16
A/Tr/Turkey/1/05
2005/10/08
A/Sw/Slovenia/760/06
2006/02/12
A/Dk/Egypt/2253-3/06
2006/06/16
A/Egypt/902782/06
2006/02/17
A/Egypt/902786/06
2006/02/17
A/Ck/Burkina Faso/13.1/06
2006/05/23
A/Turkey/Ivory Coast/4372-2/06
2006/12/16
A/Ck/Russia_Krasnodar/2/07
2007/01/29
A/Ck/Sudan/2115-12/06
2006/05/16

distances from original Qinghai-reassortant-strain (~10.February 2005):
97,69,68,48,59,53,61,61,71,27,38,45,42,50,25,25,21 ,23,23,11,18,35,0
23,53,43,45,52,33,35,36,46,48,46,49,57,74,48,54,56 ,48,55,65,50,73,72
55,57,57,39,56,55,49,53,45,41,54,51,44,42,43,63,54 ,46,63,71,71,71
74,79,76,70
16.09.2007, 21:57
gsgs

RE: Qinghai-Viren

ich hab das nochmal gecheckt.
Irgendwas scheint faul zu sein mit dem Virus aus
Ungarn/Suffolk Anfang des Jahres.
Merkwuerdig, dass das noch niemandem aufgefallen ist.

Der hat zu wenige Mutationen zum Ur-Qinghai-Virus.

Ist ziemlich verschieden von anderen bekannten Viren,
aber noch am aehnlichsten zu den Viren aus Tuerkei,Irak 2006.

Sieht nach Sabotage aus - El Kaida hat letztes Jahr irgendwelche
kranken Huehner eingefroren und dann damit im Januar
die Bernard-Matthews Lieferung in Ungarn infiziert.
Oder so.

Oder das Virus hat irgendwie anders eingefroren ueberlebt.

Ich hab sowas schon gesehen bei Schweine-Grippe,
aber nur sehr selten. Mysterioes.
16.09.2007, 22:12
Sefina

RE: Qinghai-Viren

Zitat:

Original von gsgs

Sieht nach Sabotage aus - El Kaida hat letztes Jahr irgendwelche
kranken Huehner eingefroren und dann damit im Januar
die Bernard-Matthews Lieferung in Ungarn infiziert.
Oder so.

Gehts noch? Überdenk das bitte noch mal!
16.09.2007, 23:16
Sarcelle

Die Sequenzen unerscheiden sich nur in einer AS, Im blastp allerdings sind sie erst an auf den hinteren Plätzen.

Request Id = EV5XPJFG012
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi
16.09.2007, 23:23
Sarcelle

Blastp ergibt das:

Code:

gb|ABC48787.1| hemagglutinin precursor [Influenza A virus (A/... 1186 0.0 dbj|BAE48316.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/whooper s... 1185 0.0 gb|ABC70712.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Cygnus olo... 1184 0.0 gb|ABL74499.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/goosander/... 1184 0.0 gb|ABG20472.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Kr... 1184 0.0 gb|ABD95991.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/mallard/Ba... 1184 0.0 gb|ABQ23906.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/tufted duc... 1184 0.0 gb|ABO38263.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/cygnus olo... 1184 0.0 gb|ABI23979.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/duck/Tuva/01/ 1183 0.0 gb|ABD73284.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/turkey/Tur... 1183 0.0 gb|ABD32128.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Cygnus olo... 1183 0.0 gb|ABC87315.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Cygnus olo... 1183 0.0 gb|ABB43059.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/duck/Novos... 1183 0.0 gb|ABO76641.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/goose/Kras... 1183 0.0 gb|ABL63759.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/tufted duc... 1183 0.0 gb|ABI95338.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Su... 1183 0.0 gb|ABH09488.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Vo... 1183 0.0 gb|ABO77034.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Iv... 1182 0.0 gb|ABS50241.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/duck/Switz... 1182 0.0 gb|ABQ43815.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Ru... 1182 0.0 gb|ABL63760.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/eagle owl/... 1182 0.0 gb|ABJ16862.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/ostrich/Ni... 1182 0.0 gb|ABO76638.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Su... 1182 0.0 gb|ABJ16873.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Ni... 1182 0.0 gb|ABE26829.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/swan/Germa... 1182 0.0 gb|ABI95349.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Su... 1182 0.0 gb|ABG38185.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Cr... 1182 0.0 gb|ABH85395.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/duck/Novos... 1181 0.0 gb|ABO76639.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Omsk/ 1181 0.0 emb|CAL48276.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Canada go... 1181 0.0 gb|ABO44200.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Af... 1181 0.0 gb|ABF61761.1| haemagglutinin [Influenza A virus (A/cat/Germa... 1181 0.0 gb|ABG81038.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Su... 1181 0.0 emb|CAL48274.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/common bu... 1181 0.0 gb|ABH09484.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Ad... 1181 0.0 gb|ABG81037.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Su... 1181 0.0 gb|ABQ23907.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/mute swan/... 1180 0.0 gb|ABO44244.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/turkey/Egy... 1180 0.0 gb|ABJ16928.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/duck/Cote ... 1180 0.0 gb|ABB43058.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/grebe/Novo... 1180 0.0 dbj|BAE48317.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/whooper s... 1180 0.0 gb|ABO76640.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/goose/Suzd... 1180 0.0 gb|ABO44288.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/turkey/Ivo... 1180 0.0 gb|ABO44222.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Af... 1180 0.0 gb|ABO31434.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Mo... 1180 0.0 dbj|BAE96961.1| haemagglutinin [Influenza A virus (A/whooper ... 1180 0.0 gb|ABO52742.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Su... 1179 0.0 dbj|BAE48315.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/bar-heade... 1179 0.0 emb|CAM59138.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/N... 1179 0.0 gb|ABL63764.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/swan/Bavar... 1179 0.0 gb|ABI34124.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/grebe/Tyva... 1179 0.0 gb|ABH09486.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/goose/Crimea/ 1179 0.0 gb|ABG75616.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/grebe/Tyva... 1179 0.0 gb|ABG81039.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Eg... 1179 0.0 emb|CAL48266.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/eagle owl... 1179 0.0 emb|CAM59136.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/N... 1178 0.0 gb|ABQ14461.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Ga... 1178 0.0 gb|ABP96849.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Egypt/2256... 1178 0.0 gb|ABN70709.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Eg... 1178 0.0 gb|ABG81040.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/duck/Egypt... 1178 0.0 gb|ABE68921.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Bar-headed... 1178 0.0 gb|ABQ14460.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Ga... 1178 0.0 emb|CAL48265.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Canada go... 1178 0.0 gb|ABH09485.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Ta... 1178 0.0 gb|AAZ16277.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Bar-headed... 1178 0.0 gb|ABO64688.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Eg... 1177 0.0 gb|ABO64692.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/duck/Egypt... 1177 0.0 gb|ABO64689.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Eg... 1177 0.0 gb|ABE68923.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Bar-headed... 1177 0.0 gb|ABH09489.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/cat/Dagestan/ 1177 0.0 gb|ABQ97197.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Gh... 1177 0.0 emb|CAM59141.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/N... 1177 0.0 gb|ABN70708.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Eg... 1177 0.0 gb|ABC66561.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/migratory ... 1177 0.0 emb|CAL48267.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/duck/Germ... 1176 0.0 gb|ABO30505.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/turkey/Eng... 1176 0.0 gb|ABJ16917.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Co... 1176 0.0 gb|ABJ16807.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Af... 1176 0.0 gb|AAZ16276.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Bar-headed... 1176 0.0 gb|ABJ98948.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Na... 1176 0.0 gb|ABJ96713.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Guinea fow... 1176 0.0 gb|AAZ16279.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Bar-headed... 1176 0.0 gb|ABN70706.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Eg... 1176 0.0 gb|ABN70707.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Eg... 1176 0.0 emb|CAM59140.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/N... 1175 0.0 gb|ABP96847.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Egypt/1731... 1175 0.0 gb|AAZ16278.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Bar-headed... 1175 0.0 emb|CAM59135.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/N... 1174 0.0 gb|ABN70710.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Eg... 1174 0.0 gb|ABJ53537.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/cygnus olo... 1174 0.0 emb|CAL48280.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/stork/Ger... 1174 0.0 gb|ABO64693.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/duck/Egypt... 1174 0.0 gb|ABN70711.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/duck/Egypt... 1174 0.0 gb|ABM54180.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Egypt/1472... 1174 0.0 gb|ABC66562.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/migratory ... 1174 0.0 emb|CAM59139.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/N... 1172 0.0 emb|CAM59137.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/N... 1172 0.0 gb|ABM54179.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Egypt/1472... 1172 0.0 gb|ABG81041.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/chicken/Su... 1171 0.0 gb|ABP96848.1| hemagglutinin [Influenza A virus (A/Egypt/1902... 1171 0.0

Keine Ahnung, warum turkey England soweit hinten erscheint, obwohl 100 % Id besteht.
17.09.2007, 07:26
gsgs

ich nehm nur Nukleotide-Differenzen hier und nur volle Genoms.
Das ist verlaesslicher zur Bestimmung des Verwandtschaftsgrades.

Obiges Bild zeigt einmal mehr, warum es wichtig ist dass wir
neue Sequenzen mit vollem Genom von diesem Jahr bekommen.
War der Ungarn-Virus eine Sackgasse ? Zeigen andere
Viren evtl. ein aehnliches "einfrieren" ?
Krasnodar 2007 zeigt ebenfalls ueberraschend wenige Mutationen,
aber bei weitem nicht so krass.
Russland war bisher sehr freigiebig im Veroeffentlichen
von Genom-sequenzen, bleibt zu hoffen, dass die
wenigstens bald die juengsten Sequenzen aus Sibirien
veroeffentlichen.

Bzgl. der moeglichen Sabotage oder Laborausbruch
waere es interessant zu wissen, wo Viren evtl.
ein Jahr lang in freier Wildbahn ueberleben koennen
in Vorderasien/Mittelasien ? Kaukasus ?
17.09.2007, 09:27
Sarcelle

Wenn Du Chen's 10-3 substitutions /year and site heranziehst, stimmt das jedenfalls nicht überein.

Auch ein Laborzusammenhang wäre denkbar.

Hast Du NA und den Rest angesehen?
17.09.2007, 09:44
gsgs

NA und all die anderen Gene.
Dies sind alles nur volle Genoms, wie gesagt.
Ca.13000 Nucleotide im Durchschnitt, schaetz ich.

Vielleicht koennte ich mal das gleiche machen indem ich
nur synonyme dritte-codon-Positionen betrachte.
Ich vermute das Ergebnis waer dasselbe.

ich hab das Bild jetzt auch hier:
http://magictour.free.fr/panflu/qinghai.bmp
sodass ich leicht neue Viren einfuegen kann,
andere Aenderungen einfuegen kann.

Hier ist ein Bild mit Differenzen zwischen irgendwelchen
Paaren von Influenza-Viren ueber Zeit:

http://magictour.free.fr/panflu/difg1l.JPG

man beobachtet fast immer die Aufnahme dieser
synonymen Veraenderungen.
Seltene Ausnahmen sind die 1977-Pandemie, Kanada-Schweine,
2005 Labor-Ausbruch von H2N2 und einige andere.

sieh hier fuer eine Liste mit der Anordnung aller Mutationen:
http://www.flutrackers.com/forum/showpost.php?p=101055

(ich kann solch lange Tabellen hier nicht posten,
nur 10000 Bytes erlaubt im Huehnerforum)
17.09.2007, 10:15
gsgs

ich spekulier mal, dass
das Virus vielleicht auch schon ein Jahr lang irgendwo
im Tiefkuehlfach gelegen haben koennte, dann aufgetaut
wurde und als Gammelfleisch an die Ungarischen Gaense
verfuettert wurde.

Aber Terroristen koennten doch auch ganz einfach Viren einfrieren
und dann Pandemien ausloesen.
So wie das Grippe-Virus von 1951, dessen mysterioesem
Wiederauftauchen in 1977 wir Millionen Tote zu verdanken haben...
17.09.2007, 12:02
Cassandra

Zitat:

Original von gsgs
ich spekulier mal, dass
das Virus vielleicht auch schon ein Jahr lang irgendwo
im Tiefkuehlfach gelegen haben koennte, dann aufgetaut
wurde und als Gammelfleisch an die Ungarischen Gaense
verfuettert wurde.

hallo

hier offenbahrt sich nun die traurige realität ..wir habens ja schon lange befürchtet aber da scheint sich jemand wirklich noch nichtmal im ansatz mit den tieren zu beschäftigt haben denn sonst wüsste er das Gänse reine Vegitarier sind ..die totale ignoranz halt und der beweis das nur links zu posten und sich mit fremden zitaten zu schmücken mit wissen rein garnichts zu tun hat

vielleicht sollte man diese tolle aussage auch bei den amis posten damit sie ein bissi was zu lachen haben :laugh

und so aussagen und spekulationen zeigen uns auch wie fachlich genau in der Wissenschaftsecke gearbeitet wird :roll

Tina

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